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世界首個八倍體動物中華鱘全基因組測序完成
2023-09-11 09:47:59   來源: 中國新聞網(wǎng)

據(jù)中國長江三峽集團(tuán)有限公司長江生物多樣性研究中心8日消息,該研究中心研究團(tuán)隊歷經(jīng)十年艱苦努力和探索,成功完成世界首個八倍體動物基因組中華鱘的全基因組測序和組裝。

  中華鱘基因組包含264條染色體且半數(shù)染色體為微小染色體,其全基因組測序組裝難度堪比基因組研究領(lǐng)域的“三峽工程”。研究團(tuán)隊在經(jīng)歷多輪測序和組裝的反復(fù)嘗試后,完成了中華鱘高質(zhì)量基因組序列圖譜組裝。

2023年3月25日,20萬尾中華鱘在湖北宜昌放歸長江。(資料圖)周星亮攝

  該研究成果為中華鱘遺傳功能、種質(zhì)保護(hù)和種群建設(shè)等研究提供了首個參考基因組,解決了長期因無參考基因組造成中華鱘研究在分子生物學(xué)水平分析的盲目性和隨機性,制約中華鱘遺傳多樣性評估、功能基因標(biāo)記開發(fā)、繁育和生長機理等保護(hù)理論和技術(shù)研究深入推進(jìn)的關(guān)鍵難題。

  在此基礎(chǔ)上,該團(tuán)隊還闡明了中華鱘為同源八倍體物種,回答了鱘形目魚類研究領(lǐng)域長達(dá)半個世紀(jì)的四倍體和八倍體的倍性組成及來源爭論。從基因組角度,揭示了中華鱘的進(jìn)化軌跡和多倍體形成過程:在2.1億年前,鱘形目魚類祖先經(jīng)歷鱘魚特異的全基因組加倍形成四倍體,并且在約3500萬年前中華鱘祖先再次發(fā)生物種特異的全基因組加倍,在二倍化和全基因加倍的雙重作用下最終形成當(dāng)前復(fù)雜八倍性。

  該項研究成果,為更好地開展中華鱘等鱘形目魚類的基因組學(xué)、遺傳育種、種質(zhì)保護(hù)、多倍體進(jìn)化等研究提供了重要理論和數(shù)據(jù)支撐,更好地保障了中華鱘等鱘形目魚類的保護(hù)工作向深入化和精細(xì)化開展,將在今后中華鱘高效保護(hù)研究中發(fā)揮重要支撐作用。


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